项目编号 | BA202100180 | 项目名称 | T细胞免疫组库绝对定量测序 |
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经办人单位 | 第一医院(白求恩第一临床医学院) | 经办人 | 吕国悦 |
预算金额 | 270000.00 人民币 | 成交金额 | 265000.00 人民币 |
成交供应商 | 武汉康测科技有限公司 | 质保期 | 12 月 |
联系地址 | 湖北省-武汉市-武汉东湖新技术开发区高新大道666号武汉 | 采购单位 | 吉林大学第一医院(白求恩第一临床医学院) |
付款方式 | 服务完毕验收合格后100%付款。 | ||
供应商联系手机 | 17786579400 | 服务时间 | 2021年03月30日 至 2021年12月31日 |
服务地址 | 吉林省-长春市-东民主大街519号 | ||
验收方式 | 以成交单为准,参考相关内容进行验收。验收程序以甲方职能部门规定为准。 | ||
售后服务要求 | 公司需依照要求提供数据分析服务,至文章发表为止。 对样本的特定TCR或抗原特异性TCR或非特异性TCR进行分析。 | ||
采购材料 | 自主采购评审报告.docx |
采购品目 | 基础医学研究服务 | 名称 | TCR绝对定量测序分析服务 |
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单位 | 项 | 数量 | 100 |
单价 | ¥2,650.00 | 总价 | ¥265,000.00 |
范围/服务内容及要求 | 实验设计: 从肝脏、血液、淋巴结、脾脏、皮肤、骨髓等人体组织器官或啮齿类实验动物组织器官中进行TCR-seq,共计100个样本。 数据收集: 1.对上述样本进行Total RNA提取并质检; 2.对合格是Total RNA进行UID TCR-seq文库(beta链)的构建; 3.对合格的文库进行高通量测序,获得测序数据。 数据分析: 1.对上述数据进行质控; 2.每组样本分析TCR丰度与种类; 3.对样本间进行差异分析; 4.按照要求获得指定样本的特定TCR频率; 具体数据分析内容如下: 1.数据预处理与质控: 1.1.原始数据质控与统计; 1.2.数据UID拆分与校正; 2.免疫组库标准分析: 2.1.校正后序列与IMGT数据库中基因片段进行比对; 2.2.提取对比结果中的V/D/J基因信息; 3.序列结构与免疫组库多样性分析: 3.1.分析CDR3序列组成与长度, 3.2.分析CDR3序列氨基酸插入与缺失; 3.3.获得CDR3序列翻译的氨基酸序列,并分析氨基酸组成; 3.4.免疫组库多样性呈现,绘制V/J基因使用频率热图; 3.5.免疫球蛋白亚型突变率分析; 3.6.样本稀释曲线分析; 4.免疫组库差异分析: 4.1.样本间多样性差异分析; 4.2.根据免疫组库进行样本间聚类分析; 4.3.样本间共有和特异性TCR分析; 5.高级分析: 根据要求进行生信分析。 |